Na mesma lógica, se supõe que as cianobactérias ou os seus precursores terão estabelecido relações de simbiose a três, com as simbioses anteriormente referidas, dando origem aos cloroplastos.
Na verdade, esta Teoria é suportada por factos concretos, dos quais destacamos os seguintes:
- As mitocôndrias, como os cloroplastos, são organitos semi-autónomos, na medida que conservam uma capacidade de se multiplicar por bipatição, totalmente assincrona da divisão da célula;
- Contrariamente aos núcleos, que se desfazem quando da divisão das celulas, as mitocôndrias e os cloroplastos mantêm a sua integridade;
- As mitocôndrias e os cloroplastos são os únicos organitos que são limitados por duas membranas;
- Os lípidos das membranas internas das mitocôndrias e dos cloroplastos encontram-se nas membranas de procariontes livres, mas não nas membranas de células eucarióticas;
- As mitocôndrias e os cloroplastos possuem o seu próprio genoma , e este é constituído, como nas células procarióticas, por uma única macromolécula de ADN fechada em anel e enovelada;
- Os genes do ADN destes organitos têm a mesma estrutura dos genes de procariontes;
- As mitocôndrias e os cloroplastos possuem os seus próprios ribossomas, pelo que são capazes de efetuar a síntese de uma parte das proteínas de que necessitam para o seu próprio funcionamento. Os ribossomas são do tipo 70 S, como os das bactérias.
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